第九师医院前身是原工二师医院、原农七师三管处医院和原工二师门诊部的联合体,简称“两院一部”。1962年“伊塔事件”发生后,兵团实行“三代(代耕、代牧、代管)”任务。1969年5月随着农九师的成立,“两院一部”合并组建农九师医院,床位编制150张。1975年撤销兵团建制后,农九师医院划归塔城地区,改成为塔城地区第二人民医院。1982年4月,塔城地区第二人民医院随兵团和农九师建制的恢复而恢复,称兵团农九师医院。1998年10月医院通过“二甲”评审,2013年9月通过“二甲”复审,2018年12月顺利通过“三甲”评审。荣获全国文明单位、全国模范职工之家、全国敬老文明号、全国五四红旗团委、全国学雷锋活动示范点,自治区“民族团结一家亲”活动先进集体,兵团先进基层党组织、兵团文明单位、兵团民族团结进步模范集体、兵团维稳戍边劳动奖状等荣誉称号。
医院占地面积7.38万㎡,业务用房面积4.5万㎡;现编制床位300张,实际开放床位505张;人员编制405人;设置有8个综合管理部门、33个专业技术科室。医院年门(急)诊接诊量25万人次,出院病人1.7万人次,手术5800余例。
医院建有门诊楼、外科楼、住院综合楼、眼科中医科综合楼,承担着九师师直、团场各族人民群众的医疗保健任务,同时辐射至周边塔城、额敏、裕民、托里等县市各族人民群众的就医看病工作,能够开展各类腹腔镜微创手术、骨科各类关节置换手术、人工心脏起搏器植入术、冠状动脉支架植入术,阴式子宫切除术、特殊人工晶状体植入术等本地区较为先进的技术。一代又一代的九师医院人用天使般的爱心,躬耕不缀、戍守健康,发挥着兵团“稳定器、示范区、大熔炉”的特殊作用,为兵地繁荣与发展以及各民族兄弟的身体健康撑起了一片湛蓝的天空。